Les activités de surveillance du laboratoire concernent principalement :

• la rage terrestre en France et en Europe, et les lyssavirus chez les chauves-souris, via notamment  la surveillance événementielle et programmée ;
• Echinococcus multilocularis en France ;
• Mycobacterium bovis, agent de tuberculose bovine, dans la faune sauvage en France, dans le cadre du dispositif national dédié, Sylvatub, en collaboration avec les différents partenaires de ce dispositif ;
• la surveillance sanitaire de la faune sauvage au sens large, par une implication forte au sein de la plateforme d’épidémiosurveillance en santé animale (ESA), et notamment via l’animation du groupe de suivi faune sauvage de cette plateforme ;
• l’investigation en élevage en cas de suspicion de cas alimentaires du virus de l’encéphalite à tiques.