Unité Physiopathologie et épidémiologie des maladies équines (PhEED) du laboratoire de santé animale

Caractérisation de Taylorella asinigenitalis : phylogénie, pathogénicité et résistance aux antibiotiques

Financement : IFCE et Fonds Eperon

Reportée pour la première fois en 1995, T. asinigenitalis est étroitement apparentée à l’agent de la métrite contagieuse équine (T. equigenitalis). En 2019, la moindre virulence de cette espèce bactérienne est remise en cause avec l’investigation d’un foyer émirati où trois juments ont montré une endométrite sévère et purulente dans les cinq jours après insémination avec la semence d'un âne positif à T. asinigenitalis. Ce projet de thèse vise à une meilleure caractérisation de cette espèce bactérienne aux travers de la phylogénie, de la pathogénicité et de l’antibiorésistance, afin de savoir s’il y a lieu de déclarer ou non une métrite contagieuse équine quel que soit l’espèce de Taylorella isolée.

Financement : Région Normandie RIN 2020

La chaire d'excellence "Stratégies antivirales translationnelles" est consacrée au développement et à la validation d'outils de diagnostic innovants et de traitements thérapeutiques pour les infections virales. Les recherches sont menées avec une approche translationnelle entre les virus humains et équins. Le projet est divisé en quatre objectifs intimement liés :

• appliquer les technologies de pointe à la médecine vétérinaire, afin d'améliorer les méthodes de diagnostic de l'anémie infectieuse équine (EIAV) et de l'artérite virale équine (EAV), pour une détection précoce et la prévention de la dissémination virale ;
• cartographier l'interactome fonctionnel des protéines des virus EIAV et EAV avec leur cellule hôte, afin de mieux comprendre la pathogenèse de l'infection ;
• appliquer une stratégie de réadaptation des médicaments pour identifier les molécules ayant une activité antivirale contre les virus EIAV et EAV. Identifier les molécules les plus prometteuses et améliorer leur capacité à être utilisées comme médicament afin de maximiser leur succès lors des futurs essais cliniques ;
• établir les bases de la recherche translationnelle de la virologie équine aux virus humains, comme le VIH ou les coronavirus humains, y compris le SARS-CoV-2.

Pneumonie interstitielle aiguë du poulain (Piap) : un nouvel épisode de « faites entrer l’accusé [infectieux] ? »

Financement : IFCE

La pneumonie interstitielle aiguë du poulain (Piap) est le premier type de pneumonie observé lors des autopsies sur les poulains de 1 à 6 mois, effectuées sur le site de Normandie de l’Anses. C’est une maladie caractérisée cliniquement par une détresse respiratoire aiguë et qui aboutit souvent à la mort malgré les traitements prodigués. Les survivants peuvent présenter des séquelles pulmonaires détectables par radiographie plusieurs années après la maladie, impactant leur carrière sportive. La cause de la Piap n’étant pas encore élucidée, ce projet vise à identifier les agents infectieux, connus ou inconnus et déterminer leur rôle dans la pathogénie des lésions.

Outil d’évaluation du risque parasitaire lié aux petits strongles digestifs chez les équidés en pâture pour rationaliser l’usage des antiparasitaires et prévenir le risque d’émergence de résistance

Financement : Institut français du cheval et de l’équitation (IFCE), Fonds Eperon

La lutte contre les vers parasitant le tube digestif des équidés repose essentiellement sur la vermifugation systématique à intervalles réguliers. Pourtant ces traitements fréquents favorisent le développement des résistances des parasites aux vermifuges, amenuisant progressivement leur efficacité. Afin de préserver la santé des équidés, il est urgent de raisonner cette vermifugation et de traiter seulement lors des périodes à risque parasitaire. Ce projet vise donc à mettre au point un outil d’aide à la décision permettant d’identifier les périodes à risque parasitaire d’un groupe d’équidés pour savoir quand traiter. Il prendra en compte la météo et les conduites d’élevage et de pâturage.

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Anti-Viraux Equins - Acellular Therapeutic Innovation for Equine

Financement : RIN 2020 et Fonds Eperon

L’objectif de cette étude est de caractériser le mécanisme d’action et les propriétés pharmacologiques des molécules qui ont été sélectionnées par criblage et qui montrent un effet antiviral contre deux virus respiratoires équins, l’artérite virale équine (AVE) et la rhinopneumonie équine (HVE-1). Ceci permettra d’accélérer le développement de stratégies efficaces de lutte et de contrôle de ces maladies responsables de pertes économiques majeures pour la filière équine.

Caractérisation de bioaérosols dans l’environnement cavalier-cheval : étude pilote

Financement : IFCE

Le projet Equit’Expo vise à étudier l’exposition du cavalier et du cheval vis-à-vis aux contaminants microbiologiques (bactéries et moisissures), en caractérisant les bioaérosols collectés quotidiennement durant la formation de cavaliers. Ceci s’accompagne de questionnaires et d’entretiens semi-directifs sur la perception des cavaliers de leur environnement (empoussièrement, gêne respiratoire, etc.) et du comportement des chevaux. Ce projet vise ainsi à proposer des indicateurs microbiologiques de la qualité de l’air et à dresser un premier état des lieux des situations les plus à risque d’exposition pour le couple cavalier-cheval. Ceci permettra d’orienter de futurs travaux ciblant ces situations à risque, pour à terme obtenir des outils d’évaluation et d’amélioration de la qualité de l’air afin de préserver la santé, le bien-être et la performance sportive humaine et animale lors de la pratique de l’équitation.

Financement : Région Normandie, GIS CENTAURE Recherche Équine, IFCE, Wellcome Trust, Commission européenne par l'intermédiaire de la DG SANTE (LRUE maladies équines)

Trypanosoma brucei, Trypanosoma evansi et Trypanosoma equiperdum (BrEvEq) sont trois parasites protozoaires flagellés responsable respectivement du nagana, du surra et de la dourine. Le diagnostic différentiel de ces maladies reste un défi, notamment en raison du manque de spécificité des outils de diagnostic disponibles et d’un manque de connaissance des différences intrinsèques entre ces parasites. Ce projet, réalisé en collaboration avec l’Université d’Édimbourg, vise à développer des outils de diagnostics sérologique et moléculaire spécifique de ces trypanosomoses équines et étudier les différences biologiques entre les différents parasites responsables de ces maladies.

Évaluation de la circulation et caractérisation des souches de Clostridium difficile chez les équidés

Financement : IFCE, GIS Centaure

Ce projet vise à évaluer la fréquence de C. difficile dans la population équine autopsiée en Normandie, tant dans un contexte de portage qu’en cas de diarrhée. Les souches isolées seront caractérisées afin d’évaluer la conservation des génotypes entre les différents réservoirs (équins et autres), traduisant de potentielles transmissions étendues voire zoonotiques. Enfin une évaluation de l’impact des traitements antibiotiques sur le développement des infections à C. difficile chez les équidés sera effectuée.

Étude de Klebsiella pneumoniae isolée d’équidés autopsiés et évaluation de son potentiel zoonotique

Financement : IFCE, GIS Centaure

Ce projet vise à réaliser une étude génomique de K. pneumoniae (responsable de la pneumonie chez le cheval) isolée de prélèvements d’équidés de 1996 à 2020. Un des objectifs est de caractériser et comparer le virulome et le résistome de souches équines en fonction du contexte clinique et lésionnel. Un autre objectif est de réaliser une étude rétrospective de l’évolution de la virulence et de la résistance de cette bactérie sur plus de 20 ans et de comparer ces données avec celles de souches humaines isolées d’infections nosocomiales.

Développement bactérien dans le sperme conservé d’étalon

Financement : IFCE

Le transport du sperme d’étalon à l’état liquide est une alternative à l’utilisation de sperme congelé. Il a néanmoins été observé une multiplication bactérienne dans le sperme dilué chez certains étalons malgré la présence d’antibiotiques. Ce projet vise à dénombrer et caractériser la flore bactérienne présente dans le sperme de ces étalons. La réalisation d’antibiogrammes permettra de déterminer la résistance potentielle des bactéries aux antibiotiques ajoutés dans le dilueur.

Valorisation combinée des données sanitaires et démographiques des équidés

Financement : Institut français du cheval et de l’équitation (IFCE) et Fonds Éperon

La taille, la composition et la localisation de la population française d’équidés sont très mal connues, alors que ces informations sont fondamentales pour mieux protéger leur santé. Par ailleurs, de nombreuses données sanitaires équines sont collectées séparément par différents dispositifs de surveillance, mais la dispersion de ces données ne permet pas d’en faire une valorisation globale ni d’obtenir une vision nationale de la situation sanitaire. Dans ce contexte, l'objectif du projet ValDonEqui est d'améliorer les connaissances démographiques et sanitaires des équidés en valorisant de manière synergique les données déjà collectées en routine.

Étude des interactions protéines-protéines des virus de l’anémie infectieuse équine et de la peste équine avec leur hôte équin

Financement : Anses (AMI transversalités inter-laboratoires et autres directions)

L’objectif de ce projet est de réaliser la cartographie des interactions entre protéines (protein-protein interaction, PPI) pour les protéines non structurales et accessoires des virus EIAV (anémie infectieuse équine) et AHSV (peste équine) avec leur hôte équin par la méthode du double-hybride en levure. Il s’agit d’identifier les PPI qui sont susceptibles d'être essentielles pour la réplication, la persistance et/ou la dissémination de ces virus. Le décryptage et la caractérisation de ces interactions moléculaires virus-hôtes ouvrent de nouvelles perspectives pour prévoir et simuler les émergences futures et mettre au point des contre-mesures efficaces de lutte contre ces maladies, comme de nouveaux composés anti-infectieux à large spectre et des souches atténuées pour ces agents pathogènes.

Stratégies antivirales contre trois virus équins, AVE, WNV et HVE-1 : étude pharmaco-toxicologique sur quatre molécules candidates chez le cheval

Financement : IFCE

L’objectif du projet Save Satellite est de réaliser une étude pharmaco-toxicologique chez le cheval de quatre composés susceptibles d’être efficaces contre trois maladies virales : l’artérite virale équine (AVE), le virus du Nil occidental (WNV) et la rhinopneumonie équine (HVE-1). Ce travail est une étape préliminaire indispensable à la réalisation d’une étude d’efficacité chez l’animal, pour laquelle un financement spécifique sera demandé ultérieurement.